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序列的重疊片段、創(chuàng)建虛擬克隆和設(shè)計(jì)引物,充分利用多種綜合性分析工具在一個(gè)單獨(dú)的集成軟件包里囊括了新一代序列組裝和分析所需的所有工具。選擇文件的安裝目錄后,點(diǎn)擊“Next”,如果想要自定義安裝目錄的話(huà),...
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由于測(cè)序儀機(jī)器讀長(zhǎng)的限制,在構(gòu)建文庫(kù)的過(guò)程中首先需要將DNA片段化,測(cè)序得到的序列只是基因組上的部分序列。為了確定測(cè)序reads在基因組上的位置,需要將reads比對(duì)回參考基因組上,這個(gè)步驟叫做。同時(shí)...
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當(dāng)研究一條DNA或蛋白質(zhì)序列時(shí),主要關(guān)注的是其包含的遺傳信息;當(dāng)研究?jī)蓷l或多條DNA或蛋白質(zhì)序列時(shí),則主要關(guān)注不同序列之間的差別與聯(lián)系。在生物信息學(xué)中,對(duì)生物大分子的序列比對(duì)是非常基本的工作。在生命進(jìn)...
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對(duì)于有參轉(zhuǎn)錄組,一般采取的還是比對(duì)定量的方式。2、構(gòu)建基因組索引2.:指的是針對(duì)基因組上的某一塊區(qū)域的不同版本的序列,與原始的基因組組裝序列是平行的關(guān)系,這些往往是在不同的個(gè)體中發(fā)現(xiàn)的,算是對(duì)原有參考...
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2、測(cè)序和序列比對(duì)可用于確定毒株種類(lèi)和親緣關(guān)系;在前一期病原學(xué)檢測(cè)技術(shù)的推文中介紹過(guò)PCR檢測(cè)是確定病原的利器,但是PCR出現(xiàn)陽(yáng)性條帶有可能是非特異的擴(kuò)增,需要測(cè)序驗(yàn)證;基因測(cè)序可確診,可排除污染;但...
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是一款由美國(guó)公司發(fā)行的綜合性序列工具軟件,因此這款軟件也會(huì)被人叫做。提供了所有你需要分子生物學(xué)、基因組學(xué)、結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究可以作為一個(gè)完整的軟件包。(1)用于DNA和RNA序列分析軟件,用于序列比對(duì)、基...
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測(cè)序輕松修剪序列以查找質(zhì)量較差的數(shù)據(jù)。如果要對(duì)混合群體進(jìn)行測(cè)序,請(qǐng)將參考引導(dǎo)比對(duì)的強(qiáng)大功能與從頭組裝相結(jié)合。引物序列將具有彩色堿基和應(yīng)用于它們的引物特征。使用新的會(huì)話(huà)啟動(dòng)器,可以輕松創(chuàng)建新會(huì)話(huà),向現(xiàn)有...
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模板DNA的變性:模板DNA經(jīng)加熱至94℃左右一定時(shí)間后,使模板DNA雙鏈或經(jīng)PCR擴(kuò)增形成的雙鏈DNA解離,使之成為單鏈,以便它與引物結(jié)合,為下輪反應(yīng)做準(zhǔn)備;引物設(shè)計(jì)的基本原則引物設(shè)計(jì)軟件無(wú)需繁瑣的...
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在新型冠狀病毒檢測(cè)中,以美國(guó)CDC的第一套引物探針為例,從圖1可見(jiàn),上游引物處SARS病毒有一個(gè)3-bp的插入,是不可能擴(kuò)增的,蝙蝠病毒在上游引物有4個(gè)突變,探針有1個(gè)突變,下游引物有5個(gè)突變,理論上...
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今天兩個(gè)sgRNA設(shè)計(jì)網(wǎng)站,搞定所有序列的sgRNA設(shè)計(jì)!因?yàn)槠綍r(shí)所需的sgRNA,要么是針對(duì)已知基因的引物設(shè)計(jì),要么是針對(duì)非編碼區(qū)域的引物設(shè)計(jì)。針對(duì)已知基因的引物設(shè)計(jì),推薦使用網(wǎng)站:針對(duì)非編碼區(qū)域的...
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亮點(diǎn)包括新的注冊(cè)工作流程、.文件導(dǎo)入和云數(shù)據(jù)庫(kù)。Prime的功能?點(diǎn)測(cè)平臺(tái)集成插件啟動(dòng)注冊(cè)工作流程以在生物注冊(cè)器中注冊(cè)您的序列。Prime中存儲(chǔ)安全的個(gè)人數(shù)據(jù)。引物特異性檢測(cè)通過(guò)新的引物特異性測(cè)試一步...
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今天給大家介紹一下用軟件如何導(dǎo)出序列比對(duì)圖片??梢杂脕?lái)進(jìn)行核酸和蛋白的多序列比對(duì),操作方便、簡(jiǎn)單。把要參與比對(duì)的序列加載到不同通道中。方法見(jiàn)下圖(當(dāng)然,也可以將單個(gè)序列文件逐一加載到通道中)。對(duì)導(dǎo)入的...
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