我要移除相似性在99.99%以上的序列

不過，如果使用單獨的程序進行比對，似乎又不能和參考序列的注釋信息進行關(guān)聯(lián)了。因此，序列注釋可以基于多序列比對后并利用參考序列的基因信息。移除高度相似序列我導(dǎo)入比對后的核苷酸序列，運行程序分析后，拿其中...

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dnastar引物設(shè)計 尋找PCR知識的小伙伴，朝這里看過來

PCR引物設(shè)計基本原則④引物與非特異擴增區(qū)的序列的同源性不要超過70%，引物3′末端連續(xù)8個堿基在待擴增區(qū)以外不能有完全互補序列，否則易導(dǎo)致非特異性擴增。⑤引物的5端可以修飾。在酶和引物質(zhì)量好時，不出...

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SnapGene分子生物學(xué)必備軟件

分子生物學(xué)必備軟件用它做質(zhì)粒圖譜、查找酶切位點、標(biāo)記基因片段屬性、查看引物所在位置，查看開放閱讀框所編碼氨基酸、及序列比對。每次編輯序列或模擬克隆或PCR或誘變時，該程序都會自動記錄在圖形歷史記錄中。...

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dnastar序列比對 DNASTAR Lasergene Molecular Biology

綜合序列分析軟件，用于序列比對、桑格測序、虛擬克隆、引物設(shè)計、質(zhì)粒圖譜、測序編輯等?？蓭椭瓿芍匾男蛄蟹治鋈蝿?wù)，包括多重序列比對、PCR引物設(shè)計、計算機克隆和桑格序列組裝?？寺⌒蛄序炞C多序列比對序...

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（偽）從零開始學(xué)轉(zhuǎn)錄組（5） 序列比對

順便對bam文件進行簡單QC，參考直播我的基因組系列。為了提高比對速度，就需要根據(jù)參考基因組序列，經(jīng)過BWT算法轉(zhuǎn)換成index，而我們比對的序列其實是index的一個子集。當(dāng)然轉(zhuǎn)錄組比對還要考慮到可...

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干貨 | 一款超好用的 DNA 序列比對軟件

比對軟件。比對軟件：查找等非常多的實用功能，下面我來詳細介紹一下這幾個常用的功能。再新建另一個文件，將所需序列粘貼，即可進行比對：序列翻譯成蛋白序列，還可自己進行設(shè)計每行顯示多長以及蛋白簡寫的方式。c...

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核酸序列分析工具

多序列比對分析軟件目前有很多功能強大的生物學(xué)軟件，具有豐富功能引物設(shè)計，基因序列比對，質(zhì)粒圖譜繪制、甚至實現(xiàn)了1個軟件同時對DNA、RNA和蛋白質(zhì)進行分析的功能。（1）是一款高度集成化的分子生物學(xué)應(yīng)用...

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dnastar序列比對 DNASTAR V17.4.2更新

多序列比對的增強和更新包括：有許多多序列比對工具已經(jīng)不是什么秘密了，但初始序列比對只能讓你走這么遠。Pro提供了多序列比對每個階段所需的一切，不僅是比對基因水平和基因組規(guī)模序列數(shù)據(jù)所需的算法，而且還提...

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DNASTAR-分子生物學(xué)研究的工作流程

-用于分子生物學(xué)研究、蛋白質(zhì)分析、基因組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究的完整序列分析軟件”-分子生物學(xué)研究工作流程這使得從多個比對中進一步探索序列對的相關(guān)性、將轉(zhuǎn)錄本與基因比對或在基因組中找到一個基因變得容易。序列...

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轉(zhuǎn)錄組/宏/基因組學(xué)分析流程，值得收藏

基因組學(xué)，轉(zhuǎn)錄組學(xué)，宏基因組學(xué)，我們想要了解分析步驟，就需要了解建庫原理。從頭測序，這種情況針對的是我們沒有參考基因組，需要進行基因組拼接，然后進行基因預(yù)測和功能分析。其中，BWA-MEM用于將測序r...

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dnastar序列比對 20款科研常用軟件合輯（上）

是一款功能強大的參考文獻管理軟件。是目前整合度最高的多功能序列分析軟件包，包含了一整套數(shù)據(jù)分析和管理的工具，可以進行蛋白核酸序列分析、引物設(shè)計、多序列比對、序列裝配、質(zhì)粒圖譜查看與編輯等。功能簡介：是...

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如何用DNAMAN導(dǎo)出序列比對圖？

今天給大家介紹一下如何用軟件導(dǎo)出序列比對圖片。序列的加載與比對接下來對導(dǎo)入的序列進行多序列比對，方法見下圖，參數(shù)全部保持默認(rèn)，點“下一步”就可以。更改著色之后，就可以導(dǎo)出圖片了。下面是導(dǎo)出的序列圖片在...

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